Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmnQ8C5W0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmnQ8C5W0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms