Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms