Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska3Q8C263 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms