Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FarsaQ8C0C7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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