Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms