Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh12Q8BYK4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms