Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms