Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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