Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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