Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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