Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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