Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod1Q8BVA4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms