Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcgF3Q8BTQ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcgF3Q8BTQ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms