Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms