Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms