Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpc2Q8BKV1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms