Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcal1Q8BJL0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms