Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clrn3Q8BHH8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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