Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup107Q8BH74 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup107Q8BH74 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms