Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl1Q8BH66 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms