Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Htatsf1Q8BGC0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htatsf1Q8BGC0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms