Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms