Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg4cQ811C2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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