Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms