Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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