Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Amigo1Q80ZD8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Amigo1Q80ZD8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Amigo1Q80ZD8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Amigo1Q80ZD8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Amigo1Q80ZD8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Amigo1Q80ZD8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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