Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NanogQ80Z64 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NanogQ80Z64 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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