Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg2bQ80XK6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg2bQ80XK6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms