Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Pcsk9Q80W65 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Pcsk9Q80W65 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Pcsk9Q80W65 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk9Q80W65 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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Pcsk9Q80W65 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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