Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms