Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms