Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Avl9Q80U56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms