Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NischQ80TM9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
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