Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp3Q7TST5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms