Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClmQ7TSN2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms