Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms