Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms