Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcg2Q7TMS5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcg2Q7TMS5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms