Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SyncripQ7TMK9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SyncripQ7TMK9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms