Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg4Q7TMD7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg4Q7TMD7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms