Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms