Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms