Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmed3Q78IS1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms