Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27Q6ZWU9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27Q6ZWU9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27Q6ZWU9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27Q6ZWU9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms