Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SpopQ6ZWS8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms