Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nemp1Q6ZQE4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nemp1Q6ZQE4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms