Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efr3bQ6ZQ18 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Efr3bQ6ZQ18 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efr3bQ6ZQ18 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms