Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80Q6ZPV2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ino80Q6ZPV2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80Q6ZPV2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms