Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc44a1Q6X893 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc44a1Q6X893 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms