Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl3Q6W5C0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms